Simon Hardy, ing., professeur adjoint
Pavillon Adrien-Pouliot, local 3944
T. 418 656-2131 poste 3409
Simon.Hardy@ift.ulaval.ca

Recherche

Les travaux de mon groupe de recherche portent sur la modélisation des systèmes biologiques et le développement de méthodes d'analyse pour la biologie computationnelle.

Les modèles mathématiques et computationnels développés par le laboratoire du Dr Hardy à partir de données expérimentales permettent d'analyser les dynamiques complexes inhérentes aux systèmes biologiques. Nous utilisons aussi des concepts de la théorie du contrôle pour expliquer les mécanismes de régulation cellulaire, particulièrement la signalisation cellulaire. Le savoir ainsi obtenu permet de comprendre la réponse d'un système biologique, comment le comportement normal du système peut être altéré pour devenir pathologique et quelles interventions peuvent le restaurer à un état sain. Nous développons la méthode des graphes dynamiques et utilisons les méthodes formelles issues de l'informatique comme outils d'analyse et de découverte en biologie moléculaire.

Nous collaborons avec les biologistes pour incorporer la modélisation et la simulation à même le processus expérimental en biologie pour générer de nouvelles hypothèses. Il est aussi prévu de développer une nouvelle génération de modèles théoriques de neurones qui intégrera l'électrophysiologie, la biochimie et les flux ioniques de ces cellules.

Publications

La liste complète se trouve sur Academia.edu.

  • EU Azeloglu, SV. Hardy, NJ Eungdamrong, Y Chen, G Jayaraman, PY. Chuang, W Fang, H Xiong, SR. Neves, MR. Jain, H Li, A Ma’ayan, RE. Gordon, J Cijiang He, R Iyengar, Interconnected Network Motifs Control Podocyte Morphology and Kidney Function, Sci. Signal., 4 February 2014, Vol. 7, Issue 311, p. ra12
  • Hardy, S. & Iyengar, R. (2010) Analysis of dynamical models of signaling networks with Petri nets, in Modeling in Systems Biology – The Petri net approach. Ed. Ina Koch, Wolfgang Reisig and Falk Schreiber. Springer-Verlag, p. 225-251.
  • Hardy, S. & Robillard, P. N. (2008) Petri net-based method for the analysis of the dynamics of signal propagation in signaling pathways, Bioinformatics, 24(2), 209-217.
  • S. Hardy, P.N. Robillard, Phenomenological and molecular-level Petri net modeling and simulation of long-term potentiation, Biosystems, Volume 82, Issue 1, October 2005, Pages 26–38

Affiliations

Formation et expériences professionnelles

  • Post-doctorat, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, 2007-2011
  • Ph. D. en génie informatique, École polytechnique de Montréal, 2007
  • Maîtrise ès sciences appliquées en génie informatique, École polytechnique de Montréal, 2004
  • Baccalauréat en ingénierie - génie informatique, École polytechnique de Montréal, 2004
 
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